Il existe plusieurs options très utiles :
omet la vérification racine
affiche la version en cours
ouvre une nouvelle fenêtre
ouvre un projet
affiche l'écran d'aide
De nombreux programmes - navigateurs, clients de courriels, gestionnaires de fichiers - peuvent être configurés pour ouvrir certains fichiers avec Bluefish. Par exemple, bluefish '%s' ouvre un fichier dans la fenêtre active, bluefish -n '%s' ouvre un fichier dans une nouvelle fenêtre et bluefish -p '%s' ouvre un fichier projet.